PHẦN 1 Mối quan hệ quy định giữa sự thay đổi chất lượng và môi trường của loài Cistanche Deserticola ở ba kiểu sinh thái dựa trên phân tích hệ vi sinh vật trong đất

Môi trường ảnh hưởng đến thành phần và chức năng của hệ vi sinh vật trong đất, ảnh hưởng gián tiếp đến chất lượng của cây trồng. Trong nghiên cứu này, giải trình tự amplicon 16S đã được sử dụng để tiết lộ sự khác biệt trongthành phần cộng đồng vi sinh vật đất củaCistanche Desticolaở ba kiểu sinh thái (đất mặn-kiềm, đồng cỏ và đất cát). thông qua phân tích mối tương quan về sự phong phú của cộng đồng vi sinh vật, hàm lượng glycoside phenylethanoid và các yếu tố sinh thái, mối quan hệ điều tiết giữa cộng đồng vi sinh vật và sự biến đổi chất lượng củaC. sa mạcđã được giải thích. cấu hình chức năng trao đổi chất của hệ vi sinh vật trong đất đã được dự đoán bằng cách sử dụng Tax4Fun. Dữ liệu cho thấy các cộng đồng vi sinh vật đất của ba kiểu sinh thái khác nhau đáng kể (AMOVA, P <0. 001),="" và="" sự="" đa="" dạng="" alpha="" của="" cộng="" đồng="" vi="" sinh="" vật="" đất="" đồng="" cỏ="" là="" cao="" nhất.="" phân="" tích="" hệ="" vi="" sinh="" vật="" cốt="" lõi="" đã="" chứng="" minh="" rằng="" các="" cộng="" đồng="" vi="" sinh="" vật="" đất="">C. sa mạchầu hết đều có khả năng chịu hạn, chịu mặn, kháng kiềm và chống stress, chẳng hạn như Micrococcales và Bacillales. Các dấu ấn sinh học, cụ thể là oceanospirillales (đất mặn-kiềm), Sphingomonadales (đồng cỏ) và propionibactees (đất cát), có thể phân biệt ba quần xã vi sinh vật sinh thái, được khai quật qua LEfSe và rừng ngẫu nhiên. Kết quả phân tích tương quan đã chứng minh rằng 2′-acetylacteoside có tương quan thuận với oceanospirillales trong đất mặn-kiềm. Các cấu hình chức năng trao đổi chất hiển thị các con đường trao đổi chất phong phú (chuyển hóa carbohydrate và axit amin) và xử lý thông tin môi trường (vận chuyển màng và truyền tín hiệu). Nhìn chung, thành phần và chức năng của các vi sinh vật trong đất được coi là những yếu tố quan trọng đối với sự thay đổi chất lượng củaC. sa mạctrong các kiểu sinh thái khác nhau. Công việc này đã cung cấp cái nhìn mới về mối quan hệ điều tiết giữa môi trường, cộng đồng vi sinh vật trong đất và sự thay đổi chất lượng thực vật.

Thông tin chi tiết vui lòng liên hệ:Joanna.jia@wecistanche.com

Cistanche Desticola có nhiều tác dụng, bấm vào đây để biết thêm

Cistanche Desticolalà một loài thực vật ký sinh không quang hợp, có thể phát triển trong môi trường sống khô hạn, chẳng hạn như đất cát và mương sông khô, cũng như trong điều kiện căng thẳng, chẳng hạn như đất mặn-kiềm1. Loài thực vật này ký sinh trên rễ của loài psammophyte Haloxylon ammodendron, cho thấy khả năng chống chịu mạnh mẽ với các điều kiện môi trường khắc nghiệt2. Thực vật dựa vào sự tương tác có lợi giữa rễ và vi sinh vật để lấy chất dinh dưỡng, thúc đẩy sự phát triển và chống lại sự căng thẳng từ bên ngoài3. Trong khi đó, hệ vi sinh vật trong đất chi phối chu trình sinh hóa của các chất đa lượng, vi lượng và các nguyên tố khác cần thiết cho sự phát triển của thực vật4. Tuy nhiên, mối quan hệ giữaC. sa mạcvà vi sinh vật đất ở tầng sinh quyển vẫn chưa rõ ràng. Do đó, trình bày hệ vi sinh vật đất trong tầng sinh quyển củaC. sa mạclà cần thiết.

C. sa mạcthường được sử dụng ở Đông Á, Trung Á, Bắc Phi và các nước khác như một loại thực phẩm và thuốc chăm sóc sức khỏe để cải thiện trí nhớ, tăng cường chức năng tình dục và bảo vệ gan5,6. Các thành phần hoạt động chính củaC. sa mạclà phenylethanoid glycoside (PhGs), iridoids, lignans và polysaccharid. Trong số các thành phần này, PhGs là các thành phần tích cực7. Nghiên cứu trước đây báo cáo rằng nội dung của PhG trong các mô hình sinh thái khác nhau củaC. sa mạcphân hóa đáng kể, trong đó 2'-acetylacteoside có thể được sử dụng làm chất đánh dấu hóa học để phân biệtC. sa mạcsản xuất ở Tân Cương và Nội Mông1. Các nghiên cứu về quần xã vi sinh vật đã chỉ ra rằng quần xã vi sinh vật có thể điều chỉnh sự trao đổi chất của vật chủ của chúng8,9. Do đó, so sánh mối quan hệ giữa quần xã vi sinh vật và các chất trao đổi chất trong đất ở tầng sinh quyển củaC. sa mạctrong các kiểu sinh thái khác nhau là rất cần thiết.16S amplicon giải trình tự các mẫu đất ở tầng sinh quyển thực vật đã được thực hiện để khám phá sự đa dạng của các cộng đồng vi sinh vật, cung cấp những hiểu biết mới về mối quan hệ giữa thực vật và các cộng đồng vi sinh vật trong đất10,11. Ví dụ, mối liên hệ giữa sự phân bố và động lực của nấm nội sinh với C. songaricum và N. tangutorum đã được điều tra trong các nghiên cứu về hệ vi sinh vật bằng cách sử dụng giải trình tự thông lượng cao11. Trong nghiên cứu này, chúng tôi thực hiện giải trình tự amplicon rRNA 16S để thu được các vi sinh vật trong đất củaC. sa mạctrong các kiểu sinh thái khác nhau. Sự khác biệt của cộng đồng vi sinh vật đất trong các kiểu sinh thái khác nhau cũng được so sánh và các dấu ấn sinh học có thể phân biệt ba kiểu sinh thái đã được khai quật. Sau đó, phân tích mối tương quan được tính toán bên cạnh sự phong phú của cộng đồng vi sinh vật chính, hàm lượng PhGs và các yếu tố sinh thái, và mối quan hệ điều tiết đã được khám phá. Cuối cùng, chức năng của các vi sinh vật trong đất củaC. sa mạctrong các kiểu sinh thái khác nhau đã được dự đoán.

Nguyên liệu và phương pháp

Nghiên cứu mô tả địa điểm và lấy mẫu.Theo điều tra của feld,C. sa mạccó ba kiểu sinh thái chính, bao gồm đất mặn-kiềm, đồng cỏ và đất cát. Vào tháng 4 năm 2017, chúng tôi đã thu thập các mẫu đất đại diện cho các kiểu sinh thái chính củaC. sa mạcở Trung Quốc. Các mẫu đất mặn-kiềm được thu thập từ hồ Ebinur (AB1, AB2, AB3) và bãi biển Baicheng (BJ1, BJ2, BJ3, BJ4, BJ5) ở tỉnh Tân Cương. Các mẫu đất đồng cỏ được lấy từ Làng Tula (TL1, TL2, TL3, TL4, TL5) ở tỉnh Tân Cương. Các mẫu đất của đất Sandy được thu thập từ Alxa (AL1, AL2, AL3, AL4, AL5, AL6) ở tỉnh Nội Mông và quận Minqin (GS1, GS2), quận Changcheng (GS3, GS4) ở tỉnh Cam Túc. Thông tin kinh độ, vĩ độ và độ cao của tất cả các điểm lấy mẫu được thể hiện trong Bảng 1 và Hình 1. Tại vị trí luyện kim, chúng tôi sử dụng một mũi khoan hình trụ bằng thép không gỉ có đường kính 5 cm để thu gom đất liền kề với thân cây mọng nước củaC. sa mạcvà vật chủ của nó, và ngay lập tức bảo quản nó trong tủ lạnh di động ở –20 độ. Sau khi vận chuyển đến phòng thí nghiệm, các mẫu đất được đưa qua rây 2- mm để loại bỏ các mô thực vật, rễ, đá, v.v. và được bảo quản ở nhiệt độ –20 độ trong tủ lạnh trước khi thực hiện thí nghiệm.

Tách chiết DNA và giải trình tự rRNA 16S.DNA đất được chiết xuất bằng Bộ công cụ phân lập DNA PowerSoil (Phòng thí nghiệm MoBio, Carlsbad, CA) theo hướng dẫn 12. Độ tinh khiết và chất lượng của DNA bộ gen được kiểm tra bằng 0. Điện di gel agarose 8 phần trăm và nanodrop.

Vùng siêu biến V 3- V4 của gen 16S rRNA của vi khuẩn được khuếch đại với cặp mồi 338F (ACTCCTACGGGAGGCAGCAG) và 806R (GGACTACHVGGGTWTCTAAT) 13. Đối với mỗi mẫu đất, một chuỗi mã vạch 10- chữ số được thêm vào đầu 5 ′ của mồi thuận và nghịch (Công ty Allwegene, Bắc Kinh) 12. PCR được thực hiện trên Mastercycler Gradient (Eppendorf, Đức) sử dụng 25 thể tích phản ứng chứa 12,5 ul KAPA 2G Robust Hot Start Ready Mix, 1 µl mồi thuận (5 µM), 1 µl mồi ngược (5 µM), 5 µl DNA (tổng số lượng khuôn mẫu là 30 ng) và 5,5 µl H2O. Các thông số chu kỳ như sau: 95 độ trong 5 phút, tiếp theo là 28 chu kỳ 95 độ trong 45 giây, 55 độ trong 50 giây và 72 độ trong 45 giây, với độ giãn fnal ở 72 độ trong 10 phút. Ba sản phẩm PCR cho mỗi mẫu được gộp lại để giảm thiểu sai lệch PCR ở mức phản ứng. Các sản phẩm PCR được tinh chế bằng cách sử dụng Bộ chiết xuất gel QIAquick (QIAGEN, Đức) và sau đó được định lượng bằng PCR14 thời gian thực.

Giải trình tự sâu được thực hiện trên nền tảng MISeq tại Công ty Allwegene (Bắc Kinh). Sau khi chạy, phân tích hình ảnh, gọi cơ sở và ước tính lỗi đã được thực hiện bằng cách sử dụng Đường ống phân tích Illumina Phiên bản 2.614.

Cistanchetubulosa có thể chống lão hóa

Phân tích dữ liệu.Dữ liệu thô đã được sàng lọc lần đầu và các chuỗi đã bị loại bỏ dựa trên các kết luận sau: các chuỗi ngắn hơn 2 0 0 bp có điểm chất lượng thấp (Nhỏ hơn hoặc bằng 20) và chứa các cơ sở không rõ ràng hoặc không khớp trình tự mồi và thẻ mã vạch15. Các lần đọc đạt tiêu chuẩn được phân tách bằng cách sử dụng trình tự mã vạch mẫu cụ thể và được cắt bằng Đường ống phân tích Illumina Phiên bản 2.6. Sau đó, các tập dữ liệu được phân tích bằng QIIME. Các trình tự được nhóm lại thành các đơn vị phân loại hoạt động (OTU) ở mức độ giống nhau là 97 phần trăm 16 để tạo ra các đường cong độ hiếm và tính toán các chỉ số đa dạng và phong phú. Công cụ Phân loại Dự án Cơ sở dữ liệu Ribosomal được sử dụng để phân loại tất cả các trình tự thành các nhóm phân loại khác nhau15. Các phân tích phân cụm được thực hiện dựa trên thông tin OTU từ mỗi mẫu bằng cách sử dụng R để kiểm tra sự giống nhau giữa các mẫu khác nhau17. Ma trận UniFracdistances giữa các cộng đồng vi sinh vật từ mỗi mẫu được tính toán bằng cách sử dụng hệ thức Tayc và được biểu diễn dưới dạng phương pháp nhóm cặp không trọng số với cây phân nhóm trung bình số học, mô tả sự khác biệt (1- độ giống nhau) giữa nhiều mẫu18. Một nhóm cây được định dạng Newick cũng được tạo ra thông qua phân tích này. Đa dạng alpha được áp dụng trong phân tích mức độ phức tạp của đa dạng loài đối với một mẫu bằng cách sử dụng bốn chỉ số, bao gồm Chao1, loài quan sát được, đa dạng phát sinh loài (PD) toàn cây và chỉ số đa dạng Shannon. Các chỉ số này được tính toán bằng phần mềm QIIME (Boulder, CO, USA) bằng Python (v.1.8.0) (La Jalla, CA, USA) 19. Phân tích đa dạng beta được sử dụng để đánh giá sự khác biệt của các mẫu về độ phức tạp của loài. Sự đa dạng beta được tính toán bằng cách sử dụng phân tích tọa độ chính (PCoA) và phân tích cụm trong QIIME20. Việc phân tích phương sai phân tử (AMOVA) được thực hiện bằng cách sử dụng mothur. EdgeR được sử dụng để tính toán chênh lệch OTU giữa các nhóm. Heatmap.2 được sử dụng để vẽ bản đồ nhiệt, trong khi Ggplot được sử dụng để vẽ bản đồ Manhattan.

Xác định dấu ấn sinh học và hệ vi sinh vật lõi.Các phương pháp phân tích phân biệt tuyến tính (LDA) và rừng ran (RF) trên trang web của Nhà phân tích quần thể vi sinh vật21 được sử dụng để xác định hệ vi sinh vật chỉ dấu sinh học.

Trước tiên, trang web thực hiện kiểm tra tổng hạng Kruskal – Wallis giai thừa không tham số để xác định các đối tượng địa lý có mức độ phong phú khác nhau đáng kể xem xét hệ số thực nghiệm hoặc loại quan tâm, tiếp theo là LDA để tính toán kích thước hoàn hảo của mỗi đối tượng địa lý phong phú khác nhau21. Các tính năng được coi là quan trọng dựa trên giá trị p đã điều chỉnh của chúng. Mức cắt giá trị điều chỉnh mặc định=0. 05. Phân tích RF được thực hiện bằng gói randomForest5. RF là một thuật toán học có giám sát phù hợp với phân tích dữ liệu chiều cao. Phương pháp này sử dụng một tập hợp các cây phân loại, mỗi cây được phát triển thông qua lựa chọn tính năng ngẫu nhiên từ một mẫu bootstrap tại mỗi nhánh22. Phân tích hệ vi sinh vật cốt lõi đã được nhà phân tích Microbiome áp dụng từ chức năng cốt lõi trong hệ thống vi sinh vật gói R

phân tích tương quan của các quần xã vi sinh vật chính, hàm lượng PhGs và các yếu tố sinh thái.Hàm lượng của bảy phenylethanoid glycoside (PhGs) của ba dạng sinh thái của C. sa mạc, cụ thể là echinacoside, cistanoside A, acteoside, isoacteoside, 2′-acetylacteosid, tubuloside A và cistanoside F, được xác định thông qua HPLC. Các điều kiện sắc ký bao gồm cột Waters C18 (15 0 mm x 3,9 mm, 4,6 μm) và pha động bao gồm axetonitril và 0. 2 phần trăm axit formic. Cài đặt sắc ký như sau: 0–10 phút, 10 phần trăm → 15 phần trăm A; 10–30 phút, 15 phần trăm → 40 phần trăm A. Tốc độ của gà là 1 mL / phút. Bước sóng hấp thụ, thể tích tiêm và nhiệt độ cột tương ứng là 330 nm, 10 μL và 27 độ. Nghiên cứu phương pháp luận đề cập đến công việc thực nghiệm sơ bộ của nhóm tham chiếu1.

Nghiên cứu này đã thu thập 16 trạm khí tượng gần ba kiểu sinh thái củaC. sa mạcXinjiang Bole 51238, Tacheng 51133, Tori 51241, Karamay 51243, Buxail 51156, Yumin 51137, Emin

51145, Gansu Minqin 52681, Yongchang 52674, Wuwei 52679, Gulang 52784, Inner Mongolia Suikou 53419, Hangjinhouqi 53420 và Wuhai 53512. Dữ liệu của bảy yếu tố khí hậu từ 1981–2010 được dùng làm dữ liệu yếu tố khí hậu - địa phương cho phân tích tương quan sau đó.

Redundancy analysis of diferential metabolites and bioclimatic factors was performed by using Canoco 5 software23. Pearson correlation coefcient was calculated for biomarker microbiome abundance, compound con- tent and ecological factor data integration. In this study, the log2 data conversion was uniformly performed before the analysis. SPSS was used to calculate the Pearson correlation coefcient of the six biomarkers, six core micro- biomes, seven main active components of C. deserticola and the ecological factors in the three habitats, and the screening standard was as follows: pearson correlation coefcient (r) >{{0}}. 5 và giá trị p <0. 05.="" mối="" quan="" hệ="" giữa="" các="" yếu="" tố="" trên="" được="" hình="" dung="" bằng="" cách="" sử="" dụng="" cytoscape24="" (the="" cytoscape="" consortium,="" san="" diego,="" ca,="" usa,="" phiên="" bản="" 3.7.0)="" và="" pheatmap="" (gói="">

Dự đoán các cấu hình chức năng vi sinh vật của quần xã vi sinh vật.Tax4Fun25 (gói R, http: // tax4fun.gobics.de/) được sử dụng để dự đoán các cấu trúc chức năng vi sinh vật của các vi sinh vật trong các mẫu đất. Bảng OTU Biom của hệ vi sinh vật trong đất được sử dụng như một nguồn đầu vào cho quá trình đo hệ số của các mẫu đất C. sa mạc phủ. Sau đó, mức độ phong phú của lớp gen dự đoán được phân tích ở nhóm KEGG Orthology (KO) cấp độ 3. Kết quả từ Tax4Fun được phân tích trong doBy (gói R) 26.

Kết quả

Thành phần quần xã vi sinh vật. The 16S rRNA sequencing resulted in 834,323 raw reads, amongst which 522,929 passed the quality and length fltering. The data set comprised 20,511–48,337 (mean: 33,994) sequences per sample. The high-quality reads were clustered using >97% trình tự nhận dạng thành 3541 OTU vi sinh vật (Bảng 1).

Cộng đồng vi sinh vật nói chung được phân loại thành 19 phyla, 46 lớp và 87 bậc (Hình 2a, b và S1 – S3). Ở cấp độ phylum, Actinobacteria (35%), Proteobacteria (31%) và Firmicutes (15%) chiếm ưu thế trong đất mặn-kiềm. Đồng cỏ được thống trị bởi Actinobacteria (37%), Proteobacteria (29%) và Bacteroidetes (9%). Ở đất cát, Actinobacteria (42%), Proteobacteria (33%) và Firmicutes (6%) chiếm ưu thế. Ở cấp độ lớp học, Actinobacteria (25%), Gammaproteobacteria (21%) và Bacilli (15%) chiếm ưu thế ở đất mặn-kiềm, trong khi Actinobacteria (22%), Alphaproteobacteria (16%) và Bacilli (8%) chiếm ưu thế ở đồng cỏ. Ở đất cát, vi khuẩn Actinobacteria (23%), Alphaproteobacteria (20%) và Gammaproteobacteria (9%) chiếm ưu thế. Ở cấp độ đặt hàng (Hình 2c – e), Micrococcales (22 phần trăm), Oceanospirillales (15 phần trăm) và Bacillales (15 phần trăm) chiếm ưu thế ở đất mặn-kiềm. Micrococcales (11 phần trăm) và Bacillales (8 phần trăm) chiếm ưu thế ở đồng cỏ. Do đó, các đơn hàng vi khuẩn chiếm ưu thế nhất là Micrococcales (10%) và Vi khuẩn axit (7%).

Sự đa dạng của vi khuẩn đất trong ba kiểu sinh thái của C. sa mạc.Các phép đo về độ đa dạng trong mẫu (-đa dạng) cho thấy một gradient đa dạng giữa ba môi trường sống (Hình 2f và Bảng S1). Sự đa dạng alpha của quần xã vi khuẩn đất của mỗi mẫu được ước tính bằng cách sử dụng độ phong phú của quần xã (Chao 1, được biểu thị bằng tổng số OTU dự kiến ​​trong mỗi mẫu), loài quan sát, PD toàn cây và chỉ số đa dạng Shannon. Các loài được quan sát, chỉ số toàn cây Chao 1 và PD cho thấy rằng các quần xã đất đồng cỏ có độ đa dạng cao nhất, trong khi độ đa dạng của đất mặn-kiềm và đất cát là tương tự. Kết quả của đường cong thỏa mãn (Hình S1) tương tự như kết quả trên.

ActeosideTrongcistanchecó tác dụng tốt đối vớiquả thận

Kết quả AMOVA (Bảng S2) cho thấy p <0. 001,="" chỉ="" ra="" sự="" khác="" biệt="" đáng="" kể="" giữa="" ba="" môi="" trường="" sống.="" kết="" quả="" phân="" nhóm="" cây="" đa="" dạng="" theo="" khoảng="" cách="" bray="" (hình="" s2)="" của="" ba="" mẫu="" đất="" sinh="" cảnh="" cho="" thấy="" rằng="" các="" mẫu="" đất="" mặn-kiềm="" được="" tập="" hợp="" chặt="" chẽ,="" và="" khoảng="" cách="" giữa="" các="" mẫu="" đất="" đồng="" cỏ="" và="" đất="" cát="" là="" gần="" nhau.="" kết="" quả="" của="" các="" pcoa="" không="" bị="" giới="" hạn="" của="" các="" ô="" 2d="" khoảng="" cách="" unifrac="" không="" trọng="" lượng="" (hình="" 2g)="" cho="" thấy="" rằng="" các="" mẫu="" đất="" khác="" nhau="" của="" cộng="" đồng="" vi="" khuẩn="" từ="" các="" môi="" trường="" sống="" khác="" nhau="" được="" tập="" hợp="">

so sánh các quần xã vi khuẩn đất của ba kiểu sinh thái c. sa mạc.Bản đồ nhiệt độ phong phú OTU khác nhau và bản đồ núi lửa (Hình 3b, e, d, h và Bảng S3) chỉ ra rằng so với các mẫu đất cát, 24 và 17 OTU tương ứng được làm giàu và cạn kiệt ở đất mặn-kiềm ở mức độ thứ tự. Ngoài ra, so với các mẫu đất cát, 8 và 11 OTU tương ứng được làm giàu và cạn kiệt trên đồng cỏ. Biểu đồ Venn (Hình 3c, f) minh họa rằng 216 OTU bị cạn kiệt ở vùng đất cát, 8 OTU bị cạn kiệt ở vùng đất mặn-kiềm

đất và 1 OTU chồng lấn giữa đất mặn-kiềm và đất cát. Hơn nữa, 3 OTU được làm giàu trên đất cỏ, trong khi 161 OTU được làm giàu trên đất cát, bao gồm 6 OTU nằm xen kẽ giữa đồng cỏ và đất cát. Các ô ở Manhattan (Hình 3a) đã chứng minh rằng Xanthomonadales được làm giàu và cạn kiệt hơn ở đất mặn-kiềm hơn so với ở đất cát, trong khi vi khuẩn Xanthomonadaceae WWH73, nhóm đất WD2101, Vibrionales và Verrucomicroiotics bị cạn kiệt đáng kể theo mức độ. So sánh đồng cỏ với đất cát, nhóm đất Xanthomonadales, WD2101, Vibrionales và Verrucomicroioticses bị cạn kiệt đáng kể.

Cistanchesa mạc có nhiều tác dụng chữa bệnhBệnh tiểu đường

Xác định dấu ấn sinh học và quần xã vi sinh vật lõi trong ba kiểu sinh thái của C. sa mạc phủ.Các phương pháp LEfSe và RF (Hình 4a, b, d) được sử dụng để xác định các đặc điểm có mức độ phong phú khác nhau đáng kể trên các mẫu đất, tính toán kích thước hoàn thiện của mỗi đặc điểm phong phú khác nhau và xác định hệ vi sinh vật đánh dấu sinh học trong ba môi trường sống ở cấp độ thứ tự . Kết quả được trình bày trong Bảng S4 cho thấy điểm LDA của Oceanospirillales, Bacillales và Flavobactees là cao nhất trong số các loài ở đất mặn-kiềm, trong khi điểm của Sphingomonadales, Gaiellales, Rubrobacterales, Burkholderiales và Sphingobactees là cao nhất so với các loài ở đồng cỏ. Điểm LDA của vi khuẩn Propionibacteria, Rhodospirillales, Solirubrobacterales, Rhizobiales, Xanthomonadales và Pseudonocardiales chiếm ưu thế trên đất cát. Với việc loại trừ các đơn đặt hàng chưa được hoàn thiện và trùng lặp, các OTU này được phân loại thành sáu đơn đặt hàng và sự phong phú của chúng được vẽ trong một bản đồ nhiệt (Hình 4c).

Phương pháp bền vững đã được áp dụng từ chức năng cốt lõi trong hệ vi sinh vật gói R để xác định hệ vi sinh vật lõi trong ba kiểu sinh thái của C. sa mạc phủ. Hệ vi sinh vật cốt lõi này chứa sáu bậc, bao gồm Micrococcales, Bacillales, Rhizobiales, Acidimicroioticses, Streptomycetales vàSphingomonadales. Với việc loại trừ các đơn đặt hàng chưa được xác định và trùng lặp, các OTU này được phân loại thành sáu đơn đặt hàng và sự phong phú của chúng được vẽ trong một bản đồ nhiệt (Hình. 2 giờ).

Phương pháp bền vững đã được áp dụng từ chức năng cốt lõi trong hệ vi sinh vật gói R để xác định hệ vi sinh vật lõi trong ba kiểu sinh thái của C. sa mạc phủ. Hệ vi sinh vật cốt lõi này chứa sáu bậc, bao gồm Micrococcales, Bacillales, Rhizobiales, Acidimicroioticses, Streptomycetales vàSphingomonadales. Với việc loại trừ các đơn đặt hàng chưa được xác định và trùng lặp, các OTU này được phân loại thành sáu đơn đặt hàng và sự phong phú của chúng được vẽ trong một bản đồ nhiệt (Hình. 2 giờ).