Đánh giá sớm về mức độ nghiêm trọng lâm sàng của biến thể SARS-CoV -2 Omicron ở Nam Phi: Nghiên cứu liên kết dữ liệu

joanna.jia@wecistanche.com/ WhatsApp: 008618081934791

Bản tóm tắt

Tiểu sử

Biến thể SARS-CoV -2 omicron đáng lo ngại đã được xác định ở Nam Phi vào tháng 11 năm 2021 và có liên quan đến sự gia tăngCOVID -19các trường hợp. Chúng tôi nhằm mục đích đánh giá mức độ nghiêm trọng lâm sàng của nhiễm trùng với biến thể omicron bằng cách sử dụng lỗi đích gen S (SGTF) trên thử nghiệm PCR Thermo Fisher Scientific TaqPath COVID -19 làm đại diện.

Phương pháp

Chúng tôi đã liên kết dữ liệu cho quốc gia, Nam PhiCOVID -19dữ liệu ca bệnh, dữ liệu thử nghiệm trong phòng thí nghiệm SARS-CoV -2, dữ liệu bộ gen SARS-CoV -2 vàCOVID -19dữ liệu nhập viện. Đối với những cá nhân được chẩn đoán vớiCOVID -19thông qua xét nghiệm TaqPath PCR, nhiễm trùng được chỉ định là SGTF hoặc không phải SGTF. Biến thể delta được xác định bằng giải trình tự bộ gen. Sử dụng mô hình hồi quy logistic đa biến, chúng tôi đánh giá mức độ nghiêm trọng của bệnh và số lần nhập viện bằng cách so sánh các cá nhân nhiễm SGTF với không nhiễm SGTF được chẩn đoán từ ngày 1 tháng 10 đến ngày 30 tháng 11 năm 2021 và chúng tôi đánh giá thêm mức độ nghiêm trọng của bệnh bằng cách so sánh các cá nhân nhiễm SGTF được chẩn đoán từ ngày 1 tháng 10 đến tháng 11 Ngày 30 tháng 11 năm 2021, với các cá thể bị nhiễm biến thể delta được chẩn đoán trong khoảng thời gian từ ngày 1 tháng 4 đến ngày 9 tháng 11 năm 2021.

Kết quả

Từ ngày 1 tháng 10 (tuần 39), năm 2021 đến ngày 6 tháng 12 (tuần 49), năm 2021, 161 328 trường hợpCOVID -19đã được báo cáo ở Nam Phi. {{0}} người đã được chẩn đoán thông qua xét nghiệm TaqPath PCR và 29 721 trường hợp nhiễm SGTF và 1412 trường hợp nhiễm không phải SGTF đã được xác định. Tỷ lệ nhiễm SGTF tăng từ hai (3 · 2 phần trăm) 63 trong tuần 39 lên 21 978 (97 · 9 phần trăm) 22 455 trong tuần 48. Sau khi kiểm soát các yếu tố liên quan đến nhập viện, các cá nhân bị nhiễm SGTF có tỷ lệ nhập viện thấp hơn đáng kể so với những người không bị nhiễm SGTF (256 [2 · 4 phần trăm] của 10 547 so với 121 [12 · 8 phần trăm] của 948; tỷ lệ chênh lệch đã điều chỉnh [aOR] {{ 25}} · 2, 95 phần trăm CI 0 · 1 - 0 · 3). Sau khi kiểm soát các yếu tố liên quan đến mức độ nghiêm trọng của bệnh, tỷ lệ mắc bệnh nặng là tương tự giữa những người nhập viện có SGTF so với những người không nhiễm SGTF (42 [21 phần trăm] trong số 2 0 4 so với 45 [4 0 phần trăm ] trong số 113; aOR 0 · 7, 95 phần trăm CI 0 · 3–1 · 4). So với những người bị nhiễm các biến thể delta trước đó, những người bị nhiễm SGTF có tỷ lệ mắc bệnh nặng thấp hơn đáng kể (496 [62 · 5%] 793 so với 57 [23 · 4%] 244; aOR 0 · 3, 95% CI 0 · 2–0 · 5), sau khi kiểm soát các yếu tố liên quan đến mức độ nghiêm trọng của bệnh.

Diễn dịch

Các phân tích ban đầu của chúng tôi cho thấy tỷ lệ nhập viện giảm đáng kể giữa những người mắc SGTF so với những người không nhiễm SGTF được chẩn đoán trong cùng một khoảng thời gian. Những cá thể bị nhiễm SGTF có tỷ lệ mắc bệnh nặng giảm đáng kể so với những cá thể bị nhiễm biến thể delta trước đó. Một số mức độ nghiêm trọng giảm này có thể là kết quả của khả năng miễn dịch trước đó.

Kinh phí

Hội đồng Nghiên cứu Y khoa Nam Phi, Bộ Y tế Quốc gia Nam Phi, Trung tâm Kiểm soát và Phòng ngừa Dịch bệnh Hoa Kỳ, Hiệp hội Y học Phòng thí nghiệm Châu Phi, Trung tâm Kiểm soát và Phòng ngừa Dịch bệnh Châu Phi, Quỹ Bill & Melinda Gates, Wellcome Trust, và Quỹ Fleming.

cistanche pharma đặc biệt cho khả năng miễn dịch

Giới thiệu

Kể từ trường hợp SARS-CoV đầu tiên -2 vào tháng 3 năm 2020, Nam Phi đã có ba đợt dịch, với các biến thể beta (B.1.351) và delta (B.1.617.2) đáng lo ngại thống trị đợt thứ hai và thứ ba sóng, tương ứng. Vào ngày 24 tháng 11 năm 2021, Mạng lưới Giám sát gen ở Nam Phi (NGS-SA) đã báo cáo một biến thể mới của SARS-CoV -2, đã được phát hiện từ các mẫu vật được thu thập vào ngày 14 tháng 11 năm 2021, ở Nam Phi1 và ban đầu được gán cho dòng B.1.1.529, cho WHO.2 Vào ngày 26 tháng 11 năm 2021, theo khuyến nghị của Nhóm tư vấn kỹ thuật về sự tiến hóa của vi rút SARS-CoV -2, WHO đã chỉ định B.1.1.529 là omicron , 3 biến thể thứ năm của mối quan tâm. Đồng thời, có một sự gia tăng nhanh chóng trongCOVID -19các trường hợp ở tỉnh Gauteng, 2 Nam Phi, từ tuần bắt đầu từ ngày 15 tháng 11 năm 2021, với các phòng thí nghiệm xét nghiệm SARS-CoV -2 báo cáo sự gia tăng số lượng mẫu bị lỗi mục tiêu gen S (SGTF) khi được thử nghiệm trên TaqPathCOVID -19Thử nghiệm PCR (Thermo Fisher Scientific; Waltham, MA, USA). Sau đó, các trường hợp COVID -19 và các mẫu có SGTF tăng lên đã được quan sát thấy ở các tỉnh khác ở Nam Phi, dẫn đến đợt nhiễm SARS-CoV -2 lần thứ tư. Đến ngày 16 tháng 12 năm 2021, omicron đã được phát hiện ở 87 quốc gia, với nhiều quốc gia báo cáo sự lây truyền trong cộng đồng.

Biến thể omicron cần quan tâm có số lượng đột biến cao, một số đột biến đáng lo ngại do khả năng tránh miễn dịch được dự đoán trước và khả năng lây nhiễm gia tăng. Mặc dù biến thể omicron chia sẻ một số đột biến phổ biến với C.1.2 (một dòng đột biến cao được xác định trước đây ở Nam Phi), 4 biến thể beta và delta, nó cũng có 22 lần thay thế bổ sung (bao gồm cả chèn và xóa) không thấy ở bất kỳ biến thể nào khác biến thể quan tâm hoặc biến thể quan tâm cho đến nay. Trong số các sự thay thế này, 69_ Val70del của His trong protein đột biến, được quan sát trước đây trong biến thể alpha (B.1.1.7), được biết là gây ra SGTF trên TaqPathCOVID -19Kiểm tra PCR.

Dữ liệu về mức độ nghiêm trọng lâm sàng của biến thể omicron so với các biến thể SARS-CoV -2 trước đó là cần thiết để hướng dẫn lập kế hoạch và ứng phó với sức khỏe cộng đồng. DATCOV-Gen5 là một mạng lưới giám sát tiềm năng liên kết dữ liệu bộ gen SARS-CoV -2 thời gian thực với dữ liệu dịch tễ học và lâm sàng chi tiết về các trường hợp nhập viện để cho phép đánh giá nhanh mức độ nghiêm trọng và biểu hiện lâm sàng của SARS-CoV mới nổi {{8 }} các biến thể cần quan tâm. Chúng tôi nhằm mục đích đánh giá mức độ nghiêm trọng của nhiễm trùng SARS-CoV -2 với biến thể omicron ở Nam Phi bằng cách sử dụng SGTF làm đại diện cho biến thể omicron.6

lợi ích của cistanche salsatrong khả năng miễn dịch

Phương pháp

Nguồn dữ liệu và liên kết

Trong nghiên cứu liên kết dữ liệu này, chúng tôi đã liên kết dữ liệu cấp quốc gia, Nam Phi, cấp độ cá nhân từ bốn nguồn: (1) dữ liệu trường hợp COVID -19 quốc gia trong khoảng thời gian từ ngày 1 tháng 1 đến ngày 6 tháng 12 năm 2021, được báo cáo theo thời gian thực với Hệ thống Giám sát Điều kiện Y tế Thông minh của Viện Quốc gia về Các bệnh Truyền nhiễm (NICD) (NMCSS); (2) Dữ liệu xét nghiệm SARS-CoV -2 (xét nghiệm được sử dụng và giá trị ngưỡng chu kỳ PCR) trong khoảng thời gian từ ngày 1 tháng 10 đến ngày 6 tháng 12 năm 2021, cho các phòng thí nghiệm khu vực công (Dịch vụ Phòng thí nghiệm Y tế Quốc gia đã báo cáo tất cả dữ liệu xét nghiệm) và một phòng thí nghiệm lớn của khu vực tư nhân (chỉ các xét nghiệm TaqPath PCR được báo cáo); (3) Dữ liệu bộ gen SARS-CoV -2 trong khoảng thời gian từ ngày 31 tháng 3 năm 2020 đến ngày 6 tháng 12 năm 2021, cho các mẫu bệnh phẩm được gửi đến NICD từ các phòng thí nghiệm chẩn đoán tư nhân và công cộng (chủ yếu từ Gauteng, North West, Mpumalanga, và các tỉnh Northern Cape) và được thu thập thông qua chương trình giám sát viêm phổi7 ở năm tỉnh (Western Cape, KwaZulu-Natal, North West, Gauteng, và Mpumalanga); và (4) DATCOV (từ ngày 31 tháng 3 năm 2020 đến ngày 21 tháng 12 năm 2021), là một hệ thống giám sát tích cực đối với trường hợp nhập viện COVID -19, với phạm vi bao phủ toàn diện của tất cả các bệnh viện ở Nam Phi.8

Dữ liệu về trường hợp và số lần nhập viện mà chúng tôi sử dụng được lấy từ bộ dữ liệu quốc gia, toàn diện, dựa trên dân số nói trên, bao gồm toàn bộ Nam Phi. Cơ sở dữ liệu quốc gia về ca bệnh COVID -19 (NICD NMCSS) là một chương trình giám sát dựa trên phòng thí nghiệm nhận dữ liệu điện tử theo thời gian thực về tất cả các ca bệnh SARS-CoV -2 đã được phòng thí nghiệm xác nhận ở Nam Phi. Việc báo cáo các vụ việc được pháp luật ủy quyền và được kiểm toán. Mỗi trường hợp được điều tra bởi các quan chức y tế công cộng và các lỗi dữ liệu được xác định sẽ được sửa chữa trên cơ sở dữ liệu. Dữ liệu thử nghiệm trong phòng thí nghiệm SARS-CoV -2 được sử dụng trong phân tích này là dữ liệu quốc gia. Các phòng thí nghiệm bao gồm (tất cả các phòng thí nghiệm khu vực công và một phòng thí nghiệm khu vực tư nhân) đã được chọn vì các phòng thí nghiệm này có thể cung cấp dữ liệu về phương pháp thử nghiệm PCR và các giá trị ngưỡng chu kỳ, và đại diện cho hơn một nửa tổng số SARS-CoV -2 các xét nghiệm được thực hiện ở Nam Phi từ ngày 1 tháng 10 đến ngày 6 tháng 12 năm 2021. Chương trình giám sát DATCOV đã được mô tả chi tiết trước đây.8 Sử dụng DATCOV, chúng tôi đã bao gồm dữ liệu về tất cả các bệnh nhân nhập viện có SARS-CoV đã được phòng thí nghiệm xác nhận -2 xuyên suốt Nam Phi. Trong các bệnh viện khu vực công, dữ liệu được tóm tắt từ hồ sơ bệnh nhân và được thu thập trực tiếp bằng máy thu thập dữ liệu chuyên dụng, và tại các bệnh viện tư nhân và khu vực công của tỉnh Western Cape, dữ liệu được chuyển qua điện tử dưới dạng trích xuất hàng loạt hàng ngày từ hệ thống dữ liệu bệnh viện. DATCOV bao gồm những bệnh nhân nhập viện vì các triệu chứng COVID -19, bệnh nhân bị nhiễm SARS-CoV -2 tại bệnh viện và những người có kết quả xét nghiệm dương tính tình cờ khi nhập viện vì những lý do khác. Dữ liệu trường hợp và xét nghiệm được thu thập vào ngày 6 tháng 12 năm 2021 và dữ liệu DATCOV được thu thập vào ngày 21 tháng 12 năm 2021. Đối với phân tích mức độ nghiêm trọng và nhập viện, các trường hợp được kiểm duyệt đối với những trường hợp có mẫu bệnh phẩm được thu thập trước ngày 1 tháng 12 năm 2021.

Chúng tôi đã thực hiện liên kết dữ liệu cấp cá nhân bằng cách sử dụng các số nhận dạng duy nhất khi chúng tồn tại; nếu không, chúng tôi đã sử dụng kết hợp tên, họ (họ) và ngày sinh. Sau khi liên kết dữ liệu, kết hợp kiểm tra tự động và thủ công đã được sử dụng để đảm bảo độ chính xác. Sự chấp thuận về mặt đạo đức đã được Ủy ban Đạo đức Nghiên cứu Con người (Y tế) của Đại học Witwatersrand cho việc thu thập dữ liệu ca bệnh và xét nghiệm COVID -19 như một phần của giám sát bệnh truyền nhiễm thiết yếu (M210752) và cho chương trình giám sát DATCOV (M2010108).

Định nghĩa

Nhiễm trùng được phân loại là SGTF (làm đại diện cho biến thể omicron) khi một cá nhân có kết quả dương tính với xét nghiệm PCR TaqPath COVID -19 với mục tiêu gen S không thể phát hiện và ngưỡng chu kỳ là 30 hoặc ít hơn đối với ORF1ab hoặc mục tiêu gen nucleocapsid. 9 Chúng tôi giới hạn ở ngưỡng chu kỳ là 30 hoặc ít hơn để tránh phân loại sai các nhiễm trùng mà gen S không được phát hiện (do tải lượng vi rút thấp) là SGTF (nghĩa là giá trị ngưỡng chu kỳ cao). Nhiễm trùng được phân loại là không phải SGTF khi một cá nhân có kết quả dương tính với xét nghiệm PCR TaqPath COVID -19 với ngưỡng chu kỳ là 30 hoặc ít hơn đối với mục tiêu gen ORF1ab hoặc nucleocapsid và có mục tiêu gen S có thể phát hiện được. Biến thể delta được xác định bằng giải trình tự bộ gen.

Một cá nhân được phân loại là đã nhập viện nếu họ liên kết với một trường hợp trên cơ sở dữ liệu DATCOV với ngày nhập viện từ 7 ngày trước đến 21 ngày sau ngày lấy mẫu. Chúng tôi bao gồm việc nhập viện với một ngày kiểm tra trước khi nhập viện vì các bác sĩ lâm sàng có thể không nghi ngờ nhiễm SARS-CoV -2 tại thời điểm nhập viện, các xét nghiệm ban đầu có thể âm tính hoặc nhiễm trùng có thể mắc phải tại bệnh viện. Bệnh nặng được xác định là bệnh nhân nhập viện đáp ứng ít nhất một trong các tiêu chuẩn sau: được đưa vào đơn vị chăm sóc đặc biệt (ICU); nhận được bất kỳ mức độ điều trị oxy; đã được thông gió; nhận được oxy hóa màng ngoài cơ thể; bị hội chứng suy hô hấp cấp tính, hoặc đã chết. Bệnh đi kèm được định nghĩa là sự hiện diện của ít nhất một trong các bệnh sau: tăng huyết áp, tiểu đường, bệnh tim mãn tính, bệnh thận mãn tính, hen suyễn, bệnh phổi tắc nghẽn mãn tính, bệnh ác tính, HIV, và bệnh lao đang hoạt động hoặc trước đó. Dữ liệu về béo phì và mang thai không được đưa vào vì những dữ liệu này không được thu thập một cách có hệ thống. Tái nhiễm được xác định bởi một cá nhân có ít nhất một xét nghiệm COVID -19 dương tính (dựa trên PCR hoặc dựa trên kháng nguyên) hơn 90 ngày trước khi xét nghiệm COVID -19 dương tính hiện tại. Tiêm phòng được định nghĩa là có ít nhất một liều vắc xin SARS-CoV -2 (Ad.26.COV2.S [Johnson & Johnson] hoặc BNT162b2 [Pfizer-BioNTech]).

Phân tích thống kê

Giá trị ngưỡng trung bình của chu kỳ (đại diện cho tải lượng vi-rút) cho tất cả các xét nghiệm PCR COVID -19 dương tính trong khu vực công (bất kỳ xét nghiệm PCR nào) trong đợt đầu của omicron (tuần 46–48; 14 tháng 11 – 4 tháng 12 năm 2021) được so sánh với làn sóng đồng bằng sớm (tuần 18–20; ngày 2–22 tháng 5 năm 2021) bằng cách sử dụng bài kiểm tra t của Student. Các giai đoạn sóng sớm được xác định từ tuần trước khi quốc gia vượt qua tỷ lệ mắc hàng tuần là 30 trường hợp trên 100000 người đến 2 tuần sau đó.10 Khi thử nghiệm PCR bao gồm một hoặc nhiều mục tiêu gen, mục tiêu có giá trị ngưỡng chu kỳ thấp nhất được sử dụng cho phân tích.

Chúng tôi đã mô tả các đặc điểm dịch tễ học của các trường hợp nhiễm SGTF bằng cách so sánh những người bị nhiễm SGTF với những người không bị nhiễm SGTF được chẩn đoán từ ngày 1 tháng 10 đến ngày 30 tháng 11 năm 2021, những người bị nhiễm SGTF nhập viện với những người không bị nhiễm SGTF được chẩn đoán từ ngày 1 tháng 10 đến tháng 11 30 năm 2021 và các cá nhân nhiễm SGTF nhập viện được chẩn đoán trong khoảng thời gian từ ngày 1 tháng 10 đến ngày 30 tháng 11 năm 2021, với các cá nhân bị nhiễm biến thể delta nhập viện được chẩn đoán từ ngày 1 tháng 4 đến ngày 9 tháng 11 năm 2021, sử dụng phân tích hồi quy logistic đa biến.

Mức độ nghiêm trọng của các ca nhiễm trùng với biến thể SARS-CoV -2 omicron được đánh giá theo hai cách: (1) bằng cách so sánh các cá nhân có SGTF với các nhiễm trùng không SGTF được chẩn đoán từ ngày 1 tháng 10 đến ngày 30 tháng 11 năm 2021 và (2) bởi so sánh các cá nhân bị nhiễm trùng biến thể delta được chẩn đoán trong khoảng thời gian từ ngày 1 tháng 4 đến ngày 9 tháng 11 năm 2021, với các cá nhân bị nhiễm SGTF được chẩn đoán từ ngày 1 tháng 10 đến ngày 30 tháng 11 năm 2021. Dữ liệu nhập viện và mức độ nghiêm trọng được thu thập cho các trường hợp vào ngày 21 tháng 12 năm 2021, để cho phép theo dõi ít ​​nhất 3 tuần đối với kết quả nhập viện và nhập viện. Trong số những người có COVID -19 trong cơ sở dữ liệu DATCOV nhập viện từ ngày 5 tháng 3 năm 2020 đến ngày 18 tháng 12 năm 2021, thời gian trung bình từ khi nhập viện đến khi có kết quả nhập viện là 6 ngày (IQR 3–11 ngày; n {{ 29}}) nói chung, 5 ngày (2–11; n =94938) đối với những cá nhân đã chết và 6 ngày (3–10; n =304845) đối với những cá nhân còn sống. Do đó, chúng tôi không có khả năng bỏ lỡ nhiều kết quả với thời gian theo dõi tối thiểu là 3 tuần. Các phân tích mức độ nghiêm trọng bị hạn chế đối với những trường hợp nhập viện đã có kết quả tích lũy và tất cả bệnh nhân vẫn đang nằm viện đều bị loại trừ vì, trong chương trình DATCOV, thông tin chi tiết về việc nhập viện tại các bệnh viện khu vực công (ví dụ: điều trị oxy hoặc nhập viện ICU) được cung cấp tại thời điểm xuất viện hoặc chết.

Hai mô hình được tạo ra để đánh giá tỷ lệ nhập viện và bệnh nặng của những người nhập viện như là các biến kết quả. Hồi quy logistic đa biến được thực hiện để đánh giá mối liên hệ của nhiễm SGTF so với nhiễm không phải SGTF với việc nhập viện ở những người bị COVID -19 được chẩn đoán từ ngày 1 tháng 10 đến ngày 30 tháng 11 năm 2021. Chúng tôi đã kiểm soát các yếu tố được biết là có liên quan đến việc nhập viện (tức là , tuổi, giới tính, tỉnh, và lĩnh vực chăm sóc sức khỏe [tư nhân và công cộng]) và được điều chỉnh đối với trường hợp nhiễm SARS-CoV -2 đã biết trước đó. Dữ liệu về tình trạng tiêm chủng và các bệnh đi kèm chỉ có sẵn cho những người nhập viện; do đó, chúng tôi không thể kiểm soát các biến này trong phân tích này. Hồi quy logistic đa biến được thực hiện để đánh giá mối liên hệ của nhiễm SGTF so với nhiễm không phải SGTF với mức độ nghiêm trọng của bệnh giữa những người nhập viện được chẩn đoán với COVID -19 trong khoảng thời gian từ ngày 1 tháng 10 đến ngày 30 tháng 11 năm 2021, giới hạn ở những người có kết quả nhập viện đã biết vào ngày 21 tháng 12 năm 2021 (không bao gồm những người còn đang nằm viện). Chúng tôi kiểm soát các yếu tố được biết là có liên quan đến mức độ nghiêm trọng của bệnh (tức là tuổi, sự hiện diện của bệnh đi kèm, giới tính, tỉnh và lĩnh vực chăm sóc sức khỏe) và điều chỉnh cho số ngày giữa ngày lấy mẫu và ngày nhập viện, đã biết tình trạng nhiễm SARS-CoV -2 trước đó và tình trạng tiêm chủng SARS-CoV -2.

Chúng tôi đã so sánh các trường hợp nhiễm trùng biến thể delta được chẩn đoán từ ngày 1 tháng 4 đến ngày 9 tháng 11 năm 2021, với các trường hợp nhiễm trùng SGTF được chẩn đoán từ ngày 1 tháng 10 đến ngày 30 tháng 11 năm 2021. Hồi quy logistic đa biến được thực hiện để đánh giá mối liên hệ của nhiễm trùng SGTF so với nhiễm trùng biến thể delta với mức độ bệnh của những người nhập viện , giới hạn đối với những cá nhân có kết quả nhập viện đã biết vào ngày 21 tháng 12 năm 2021 (ngoại trừ những người vẫn đang nằm viện). Chúng tôi đã kiểm soát các yếu tố liên quan đến mức độ nghiêm trọng của bệnh (tức là tuổi, sự hiện diện của bệnh đi kèm, giới tính, tỉnh và lĩnh vực chăm sóc sức khỏe) và điều chỉnh số ngày giữa việc lấy mẫu bệnh phẩm và nhập viện, SARS-CoV đã biết trước đây -2 nhiễm trùng và tình trạng tiêm chủng SARS-CoV -2. Chúng tôi đã không so sánh nguy cơ nhập viện giữa những cá nhân bị nhiễm trùng biến thể delta và những người bị nhiễm trùng SGTF vì các mẫu được giải trình tự cho biến thể delta không dựa trên quần thể và chỉ đại diện cho một nhóm nhỏ các trường hợp nhiễm trùng biến thể delta được gửi đến NICD để giải trình tự. .

Các biến phân loại được tóm tắt bằng cách sử dụng phân bố tần số và so sánh bằng cách sử dụng thử nghiệm χ² của Pearson. Tương tác theo cặp được đánh giá bằng cách bao gồm các thuật ngữ sản phẩm cho tất cả các biến còn lại trong các mô hình phụ gia đa biến cuối cùng. Các phân tích được thực hiện bằng cách sử dụng Stata, phiên bản 14.1. giá trị p nhỏ hơn 0 · 05 được coi là có ý nghĩa thống kê.

Vai trò của nguồn kinh phí

Các nhà tài trợ của nghiên cứu không có vai trò gì trong việc thiết kế nghiên cứu, thu thập dữ liệu, phân tích dữ liệu, giải thích dữ liệu hoặc viết báo cáo.

Kết quả

Từ ngày 1 tháng 10 (tuần 39), năm 2021 đến ngày 6 tháng 12 (tuần 49), năm 2021, 161328 trường hợp COVID -19 đã được báo cáo trên toàn quốc, trong đó 104529 (64 · 8 phần trăm) là từ các phòng thí nghiệm được đưa vào phân tích của chúng tôi ( phụ lục trang 6–7). Trong số 104 529 này, 38282 (36 · 6 phần trăm) được chẩn đoán thông qua xét nghiệm PCR TaqPath COVID -19. Trong số các trường hợp được chẩn đoán bằng xét nghiệm TaqPath PCR, 31 133 (81 · 3 phần trăm) có giá trị ngưỡng chu kỳ từ 30 trở xuống đối với ít nhất một mục tiêu gen, trong đó 29721 (95 · 5 phần trăm) là nhiễm SGTF và 1412 (4 · 5 phần trăm) là nhiễm trùng không SGTF. Tất cả các mẫu SGTF có dữ liệu bộ gen, kể từ ngày 14 tháng 12 năm 2021, đã được xác nhận là omicron (n =30). Tỷ lệ nhiễm SGTF tăng từ hai (3 · 2 phần trăm) 63 trong tuần 39 lên 21978 (97 · 9 phần trăm) 22455 vào tuần 48 năm 2021 (hình 1). Tỷ lệ nhiễm SGTF bắt đầu tăng đầu tiên ở tỉnh Gauteng vào tuần 43 (tuần bắt đầu từ ngày 24 tháng 10 năm 2021; phụ lục trang 8). Tỷ lệ các trường hợp nhiễm SGTF sau đó đã tăng mạnh được phát hiện ở tất cả các tỉnh khác và vào tuần 47, hầu hết các trường hợp nhiễm SARS-CoV -2 ở tất cả các tỉnh đều là nhiễm SGTF (phụ lục trang 8). Giá trị ngưỡng chu kỳ trung bình đối với tất cả các xét nghiệm PCR dương tính trong khu vực công thấp hơn trong giai đoạn đầu của sóng omicron (23 · 95 [SD 6 · 06]; n =16542) so với trong giai đoạn đầu của nhiễm biến thể delta ( 26 · 98 [6 · 52]; n =10022; p<>

Chúng tôi đã so sánh các đặc điểm của tất cả các cá nhân bị nhiễm SGTF được chẩn đoán từ ngày 1 tháng 10 đến ngày 30 tháng 11 năm 2021, với các đặc điểm của những cá nhân được chẩn đoán nhiễm trùng không SGTF trong cùng khoảng thời gian. Trong các phân tích đa biến, ngoài tỷ lệ nhiễm SGTF so với không nhiễm SGTF thay đổi đáng kể theo tỉnh địa lý, những người bị nhiễm SGTF có nhiều khả năng ở độ tuổi 5–59 (so với Cao hơn hoặc bằng 60 tuổi) và được chẩn đoán bởi khu vực tư nhân (so với khu vực công) và ít có khả năng nhập viện hơn so với những người không bị nhiễm SGTF (bảng 1). Kết quả tương tự cũng được tìm thấy khi so sánh các đặc điểm giữa những người bị nhiễm SGTF nhập viện và những người không bị nhiễm SGTF nhập viện được chẩn đoán trong khoảng thời gian từ ngày 1 tháng 10 đến ngày 30 tháng 11 năm 2021 (phụ lục trang 1-3) và khi so sánh những người bị nhiễm SGTF nhập viện được chẩn đoán từ ngày 1 tháng 10 đến tháng 11 Ngày 30 tháng 4 năm 2021, với các cá thể bị nhiễm biến thể delta nhập viện được chẩn đoán trong khoảng thời gian từ ngày 1 tháng 4 đến ngày 9 tháng 11 năm 2021 (phụ lục trang 3–5).

Trong số 10 547 người bị nhiễm trùng SGTF được chẩn đoán từ ngày 1 tháng 10 đến ngày 30 tháng 11 năm 2021, 256 (2 · 4 phần trăm) được nhập viện, so với 121 (12 · 8 phần trăm) trong số 948 người không mắc SGTF nhiễm trùng (p<0·001; table="" 2).="" in="" multivariable="" analyses,="" after="" controlling="" for="" factors="" associated="" with="" hospitalization,="" individuals="" with="" sgtf="" infections="" had="" significantly="" lower="" odds="" of="" being="" admitted="" to="" hospital="" than="" did="" individuals="" with="" non-sgtf="" infections="" (adjusted="" odds="" ratio="" [aor]="" 0·2,="" 95%="" ci="" 0·1–0·3;="" table="" 2).="" in="" addition="" to="" variation="" by="" geographical="" province,="" hospital="" admission="" was="" significantly="" associated="" with="" young="" age=""><5 years;="" aor="" 9·3)="" and="" older="" age="" (≥60="" years;="" aor="" 3·1)="" compared="" with="" individuals="" aged="" 19–24="" years,="" and="" female="" sex="" (aor="" 1·3)="" versus="" male="" sex="" (table="" 2).="" individuals="" diagnosed="" by="" the="" private="" versus="" the="" public="" healthcare="" sector="" were="" less="" likely="" to="" be="" admitted="" to="" hospitals="" (aor="" 0·8;="" table="">

Trong số 382 người nhập viện được chẩn đoán mắc COVID -19 từ ngày 1 tháng 10 đến ngày 3 tháng 11 0, 2 0 21, 317 (83 phần trăm) đã tích lũy kết quả nhập viện trước ngày 21 tháng 12 năm 2021 . Sau khi kiểm soát các yếu tố liên quan đến bệnh nặng, ước tính điểm cho tỷ lệ mắc bệnh nặng ở những người nhiễm SGTF so với không nhiễm SGTF là nhỏ hơn 1, nhưng KTC 95% là rộng (aOR 0 · 7, 95% CI 0 · 3–1 · 4; bảng 3). Tỷ lệ mắc bệnh nặng thay đổi theo vùng địa lý và cao hơn đáng kể ở những người từ 60 tuổi trở lên (aOR 11 · 5) so với những người từ 19–24 tuổi (bảng 3).

Từ ngày 31 tháng 3 năm 2020 đến ngày 6 tháng 12 năm 2021, đã có 1734 bệnh nhân nhập viện với COVID -19 có sẵn thông tin về biến thể, bằng cách giải trình tự bộ gen (không phải biến thể, alpha, beta hoặc delta) hoặc TaqPath PCR (SGTF làm proxy cho biến thể omicron từ ngày 1 tháng 10 đến ngày 6 tháng 12 năm 2021). Trong số 1734 này, 792 (45 · 7 phần trăm) bị nhiễm biến thể delta từ ngày 1 tháng 4 năm 2021, (tuần 13) đến ngày 9 tháng 11 năm 2021, (tuần 45) và 212 (12 · 2 phần trăm) bị nhiễm SGTF từ Ngày 1 tháng 10 năm 2021 (tuần 39) đến ngày 6 tháng 12 năm 2021 (tuần 49; hình 2).

Trong số 1142 người nhập viện, 1 0 37 (9 0 · 8 phần trăm) đã có kết quả nhập viện vào ngày 21 tháng 12 năm 2 0 21. Sau khi kiểm soát các yếu tố liên quan đến bệnh nặng, những người bị nhiễm trùng SGTF được chẩn đoán từ ngày 1 tháng 10 đến ngày 30 tháng 11 năm 2021, có tỷ lệ mắc bệnh nặng thấp hơn đáng kể so với những người bị nhiễm trùng biến thể delta được chẩn đoán từ ngày 1 tháng 4 đến ngày 9 tháng 11 năm 2021, (aOR 0 · 3, 95 phần trăm CI 0 · 2–0 · 5; bảng 4). Ngoài sự thay đổi theo tỉnh địa lý, tuổi cao hơn (40–59 tuổi và Lớn hơn hoặc bằng 60 tuổi so với 19–24 tuổi) và có bệnh lý đi kèm có liên quan đến tỷ lệ mắc bệnh nặng tăng lên (bảng 4). Các cá nhân từ 13–18 tuổi (so với 19–24 tuổi) và phụ nữ (so với nam giới) có tỷ lệ mắc bệnh nặng thấp hơn (bảng 4).

Thảo luận

Vào tháng 11 năm 2021, biến thể omicron SARS-CoV -2 xuất hiện ở Nam Phi, đồng thời với sự gia tăng nhanh chóng số ca mắc COVID -19 được báo cáo, 2 dẫn đến đợt dịch thứ tư. Mặc dù nhiều nghiên cứu đang được tiến hành để đánh giá nhanh hành vi kiểu hình và khả năng thoát miễn dịch, điều quan trọng là phải hiểu mức độ nghiêm trọng lâm sàng của nhiễm trùng với biến thể omicron. Chúng tôi đánh giá mức độ nghiêm trọng của nhiễm trùng SGTF (đại diện cho biến thể omicron) bằng cách so sánh chúng với nhiễm trùng không phải SGTF được chẩn đoán trong cùng thời kỳ và với nhiễm trùng với biến thể delta, vốn thống trị làn sóng thứ ba ở Nam Phi. Những người nhiễm SGTF so với không nhiễm SGTF có tỷ lệ nhập viện thấp hơn 80%, nhưng chúng tôi không thể đưa ra bất kỳ kết luận chắc chắn nào về nguy cơ mắc bệnh nặng ở những người nhập viện, có thể do số lượng người được đưa vào bệnh viện thấp. trong phân tích này. Khi so sánh với nhiễm trùng biến thể delta, nhiễm trùng SGTF có liên quan đến tỷ lệ mắc bệnh nặng thấp hơn 70%. Ngoài ra, chúng tôi nhận thấy rằng ngưỡng chu kỳ PCR trung bình thấp hơn trong làn sóng omicron sớm hơn so với trong làn sóng sớm của delta, điều này có thể phản ánh tải lượng vi rút cao hơn ở những cá nhân bị nhiễm biến thể omicron so với biến thể delta.

Dữ liệu từ chương trình giám sát DATCOV cho thấy tỷ lệ nhập viện ở những người dưới 20 tuổi trong giai đoạn đầu của làn sóng thứ tư cao hơn so với làn sóng thứ ba.11 Trong nghiên cứu của chúng tôi, chúng tôi cũng phát hiện ra rằng những người bị nhiễm SGTF trẻ hơn những người không bị SGTF hoặc nhiễm trùng vùng đồng bằng; tác động này không bị hạn chế ở trẻ em vì cũng có nhiều trường hợp nhiễm SGTF hơn (so với không SGTF hoặc đồng bằng) ở nhóm tuổi trưởng thành trẻ hơn (ví dụ: 19–24 tuổi) so với nhóm tuổi trưởng thành lớn hơn (Lớn hơn hoặc bằng 60 tuổi ). Phát hiện này có thể liên quan đến việc tăng khả năng miễn dịch ở người lớn tuổi do tỷ lệ nhiễm trùng trước đó cao hơn12 hoặc tiêm chủng.13

Phát hiện của chúng tôi tương quan với dữ liệu nhập viện cho thấy trong số 1 0 61 bệnh nhân ở Nam Phi bị COVID -19 và kết quả bệnh viện đã biết, 324 (30 · 5 phần trăm) mắc bệnh nặng trong giai đoạn đầu thứ tư, so với 943 (67 · 0 phần trăm) trong số 1408 bệnh nhân trong giai đoạn đầu thứ ba.11 Đến tháng 11 năm 2021, một tỷ lệ cao dân số Nam Phi đã có một số mức độ miễn dịch SARS-CoV -2 do kết quả tự nhiên trước đó nhiễm trùng, tiêm chủng hoặc cả hai. Sau đợt SARS-CoV -2 thứ ba, 60–70 phần trăm cá nhân ở Nam Phi có bằng chứng nhiễm SARS-CoV -2 trước đó.14 Đến ngày 9 tháng 12 năm 2021, 58 phần trăm người Nam Phi trong độ tuổi 60 tuổi trở lên, 55 phần trăm từ 50–59 tuổi, 43 phần trăm từ 35–49 tuổi và 24 phần trăm từ 18–34 tuổi đã được tiêm chủng đầy đủ chống SARS-CoV -2 (một liều Ad.26. COV2 .S [Johnson & Johnson] hoặc hai liều BNT162b2 [Pfizer – BioNTech]). 13 Người ta cho rằng biến thể omicron đã tăng đáng kể khả năng thoát miễn dịch so với các biến thể khác.15 Phát hiện này, cùng với mức độ cao của pre - khả năng miễn dịch tồn tại ở Nam Phi vào thời điểm xuất hiện biến thể omicron, có nghĩa là một tỷ lệ cao các trường hợp nhiễm omicron có khả năng bị tái nhiễm và tỷ lệ này đối với omicron có thể cao hơn so với các trường hợp nhiễm trùng cùng thời với các biến thể khác. Ở Nam Phi, trong đợt COVID -19 đầu tiên và thứ hai, ít hơn 1/10 trường hợp SARS-CoV -2 được chẩn đoán.16 Chúng tôi đã tính đến những cá nhân bị nhiễm trùng được chẩn đoán và báo cáo trước đó trong phân tích của chúng tôi , nhưng, trong nhiều trường hợp, có thể là nhiễm trùng trước đó đã không được chẩn đoán. Nếu các trường hợp tái nhiễm ít nghiêm trọng hơn so với nhiễm trùng nguyên phát, thì thực tế này một phần có thể giải thích cho việc giảm mức độ nghiêm trọng của bệnh được quan sát thấy ở những người bị nhiễm bởi biến thể omicron.17 Cũng có thể là biến thể omicron đã giảm độc lực nội tại so với các biến thể khác. 18,19 Với dữ liệu sẵn có, không thể tách rời những đóng góp tương đối của mức độ miễn dịch quần thể cao so với độc lực nội tại thấp hơn đối với mức độ nghiêm trọng bệnh thấp hơn quan sát được của biến thể omicron so với biến thể delta. Dữ liệu tiêm chủng không đầy đủ và thực tế là nhiều trường hợp nhiễm trùng trước đó có thể không được phát hiện, dẫn đến việc điều chỉnh tác động của miễn dịch trước đó trong các phân tích của chúng tôi không đầy đủ.

cistanche propiedadesvìsự miễn nhiễm

Kết quả nghiên cứu này có một số hạn chế. Đầu tiên, nhiễm trùng SGTF chỉ được xác định khi xét nghiệm PCR TaqPath COVID -19 được sử dụng cho các mẫu bệnh phẩm có tải lượng vi rút cao (ngưỡng chu kỳ nhỏ hơn hoặc bằng 30); do đó, số trường hợp nhiễm SGTF bị đánh giá thấp và thiên về các vùng địa lý nơi xét nghiệm TaqPath được sử dụng phổ biến hơn. Thứ hai, SGTF được sử dụng làm proxy để phát hiện biến thể omicron. SGTF cũng có thể xác định biến thể alpha và xuất hiện không thường xuyên ở các biến thể khác, và do đó, một số bệnh nhiễm trùng có thể đã bị phân loại nhầm thành omicron.

Tuy nhiên, chúng tôi chỉ sử dụng SGTF làm đại diện cho omicron sau ngày 1 tháng 10 năm 2021 và dữ liệu bộ gen do NGS-SA tạo ra đã không xác định được biến thể alpha ở Nam Phi kể từ tháng 8 năm 2021 và ở thời điểm cao nhất, biến thể alpha chỉ là được phát hiện trong 58 (6 phần trăm) trong số 965 mẫu vào tháng 5 năm 2021.20 Omicron đã được phân loại thành ba dòng phụ, một (BA.2) trong số đó không chứa 69_ Val70del của His và do đó SGTF không thể xác định được. Dữ liệu bộ gen từ tháng 11 năm 2021, ở Nam Phi, cho thấy, trong số 881 trình tự omicron, 872 (99%) là BA.1, một (<1%) was="" ba.2,="" and="" eight="" (1%)="" were="" ba.3.20="" although="" genome="" data="" for="" non-sgtf="" infections="" were="" not="" available,="" of="" samples="" sequenced="" in="" south="" africa,="" 617="" (84·2%)="" of="" 733="" were="" delta="" and="" one="" (0·1%)="" of="" 733="" was="" omicron="" in="" october="" 2021,="" and="" 148="" (13·7%)="" of="" 1082="" were="" delta="" and="" 881="" (81·4%)="" of="" 1082="" were="" omicron="" in="" november="" 2021,="" suggesting="" that="" the="" majority="" of="" non-sgtf="" infections="" were="" delta.20="" third,="" our="" analysis="" was="" done="" during="" the="" early="" fourth="" wave,="" in="" which="" numbers="" of="" people="" with="" covid-19="" were="" small,="" patients="" with="" milder="" symptoms="" were="" more="" likely="" to="" be="" admitted="" to="" the="" hospital="" (compared="" with="" peak="" wave="" periods),="" and="" there="" could="" have="" been="" a="" lag="" in="" hospitalizations="" and="" severe="" disease="" outcomes="" caused="" by="" the="" omicron="" variant.="" we="" accounted="" for="" this="" limitation="" by="" only="" including="" hospitalized="" patients="" with="" known="" outcomes,="" censoring="" cases="" to="" ensure="" at="" least="" 3="" weeks="" of="" follow-up,="" and="" adjusting="" for="" the="" time="" interval="" between="" diagnosis="" and="" hospitalization="" in="" the="" severity="" models.="" the="" inclusion="" of="" individuals="" only="" with="" accumulated="" in-hospital="" outcomes="" could="" have="" biased="" individuals="" with="" sgtf="" infections="" towards="" shorter="" hospital="" stays;="" hence,="" this="" result="" should="" be="" interpreted="" with="" caution.="" fourth,="" we="" compared="" individuals="" with="" covid-19="" during="" the="" full="" delta="" wave="" to="" those="" with="" covid-19="" during="" the="" ascending="" phase="" of="" the="" omicron="" wave,="" which="" could="" have="" biased="" comparisons="" if="" case="" characteristics="" differ="" between="" ascending="" and="" descending="" wave="" phases="" or="" if="" the="" threshold="" for="" hospitalization="" changed="" in="" the="" different="" time="" periods.="" data="" from="" the="" datcov="" program="" suggest="" that="" the="" proportion="" of="" patients="" with="" severe="" covid-19="" does="" not="" vary="" substantially="" through="" the="" different="" wave="" phases.11="" finally,="" we="" only="" had="" information="" on="" vaccination="" status="" for="" hospitalized="" individuals="" with="" covid-19,="" which="" was="" also="" based="" on="">

Mặc dù biến thể omicron chỉ được phát hiện gần đây, nhưng đã có sự gia tăng nhanh chóng về tỷ lệ nhiễm SGTF trên tất cả các tỉnh Nam Phi trong tháng 11 năm 2021, với sự thay thế gần như hoàn toàn của biến thể delta trong khoảng thời gian 4 tuần. Các phân tích ban đầu của chúng tôi cho thấy giảm đáng kể nguy cơ nhập viện ở những người bị nhiễm SGTF so với những người không bị nhiễm SGTF được chẩn đoán từ ngày 1 tháng 10 đến ngày 30 tháng 11 năm 2021 và giảm nguy cơ mắc bệnh nặng ở những người bị nhiễm SGTF so với biến thể delta các cá thể bị nhiễm bệnh. Khả năng miễn dịch (do nhiễm trùng trước đó, tiêm chủng hoặc cả hai) ở những người bị nhiễm biến thể omicron, một phần có thể giải thích cho việc giảm mức độ nghiêm trọng này. Độc lực nội tại giảm tiềm năng liên quan đến biến thể omicron cũng có thể góp phần làm giảm mức độ nghiêm trọng COVID -19 quan sát được. Các nghiên cứu trong tương lai liên kết dữ liệu về tình trạng tiêm chủng từ các cơ quan đăng ký vắc xin có thể cung cấp thông tin về việc giảm mức độ nghiêm trọng của bệnh trong các trường hợp đột phá về COVID -19 sau khi tiêm chủng. Những dữ liệu này là sớm và những phát hiện có thể thay đổi khi có thêm thời gian theo dõi đối với những người bị nhiễm SGTF được chẩn đoán gần đây hơn.

lợi ích của cistanche salsavìsự miễn nhiễm

Người giới thiệu

1 Viana R, Moyo S, Amoako DG, et al. Sự mở rộng dịch bệnh nhanh chóng của biến thể SARS-CoV -2 omicron ở miền nam châu Phi. Thiên nhiên 2022; xuất bản trực tuyến ngày 7 tháng 1.

2 Viện Quốc gia về Các bệnh Truyền nhiễm. Tóm tắt về dịch tễ học hàng tuần của COVID -19. Nam Phi. Tuần 2}}. Năm 2021.

3 AI. Phân loại omicron (B.1.1.529): Biến thể SARS-CoV -2 cần quan tâm. Ngày 26 tháng 11 năm 2021.

4 Scheepers C, Everatt J, Amoako DG, et al. Sự phát triển liên tục của SARS-CoV -2 ở Nam Phi: một dòng mới với sự tích tụ nhanh chóng các đột biến cần quan tâm và được phát hiện trên toàn cầu. medRxiv năm 2021; xuất bản trực tuyến ngày 24 tháng 8.

5 Viện Quốc gia về Các bệnh Truyền nhiễm. Thiết lập nền tảng giám sát để đánh giá tác động lâm sàng của các biến thể SARS-CoV -2 (DATCOV-Gen) ở Nam Phi. Tháng 10 năm 2021.

6 Scott L, Hsiao N, Moyo S, et al. Theo dõi sự lây lan của omicron với dữ liệu phân tử. Khoa học 2021; 374: 1454–55.

7 Cohen C, Moyes J, Tempia S, và cộng sự. Nhiễm trùng đường hô hấp nặng liên quan đến cúm trong bối cảnh tỷ lệ hiện nhiễm HIV cao, Nam Phi, 2009–2011.

8 Jassat W, Cohen C, Tempia S, và cộng sự. Các yếu tố nguy cơ đối với COVID -19- liên quan đến tử vong khi nhập viện trong bối cảnh tỷ lệ hiện nhiễm HIV và lao cao ở Nam Phi: một nghiên cứu thuần tập. HIV năm 2021; 8: e554–67.

9 Y tế công cộng Anh. Điều tra về biến thể mới của SARS-CoV -2. Các biến thể của mối quan tâm 202012/01. Giao ban kỹ thuật 5. 2021.

10 Viện Quốc gia về Các bệnh Truyền nhiễm. Định nghĩa được đề xuất về làn sóng COVID -19 ở Nam Phi. Tháng 11 năm 2021.

11 Viện Quốc gia về Các bệnh Truyền nhiễm. Cập nhật giám sát bệnh viện hàng tuần (DATCOV). Tuần 48. 2021.

12 Madhi SA, Kwatra G, Myers JE, et al. Dân số Nam Phi miễn dịch và Covid nghiêm trọng -19 với biến thể omicron. medRxiv năm 2021; xuất bản trực tuyến ngày 21 tháng 12.

13 Bộ Y tế Quốc gia. Thống kê vắc xin mới nhất.

14 Nam Phi COVID -19 Modeling Consortium. Cập nhật mô hình COVID -19: những cân nhắc cho làn sóng thứ tư tiềm năng. Ngày 17 tháng 11 năm 2021.

15 Pulliam JRC, van Schalkwyk C, Goranty N, et al. Tăng nguy cơ tái nhiễm SARS-CoV -2 liên quan đến sự xuất hiện của biến thể omicron ở Nam Phi. medRxiv năm 2021; xuất bản trực tuyến ngày 2 tháng 12.

16 Kleynhans J, Tempia S, Wolter N, et al. Tỷ lệ lưu hành huyết thanh SARS-CoV -2 trong một nhóm thuần tập hộ gia đình ở nông thôn và thành thị trong các đợt nhiễm trùng đầu tiên và thứ hai, Nam Phi, tháng 7 2020- tháng 3 năm 2021. Cấp cứu Nhiễm trùng năm 2021; 27: 3020–29.

17 Abu-Raddad LJ, Chemaitelly H, Bertollini R. Mức độ nghiêm trọng của tái nhiễm SARS-CoV -2 so với nhiễm trùng nguyên phát. N Engl J Med năm 2021; 385: 2487–89.

18 Meng B, Ferreira IATM, Abdullahi A, et al. SARS-CoV -2 omicron tăng đột biến thoát miễn dịch, lây nhiễm và hợp nhất tế bào. bioRxiv 2021; xuất bản trực tuyến ngày 22 tháng 12.

19 HKUMed. HKUMed nhận thấy omicron SARS-CoV -2 có thể lây nhiễm nhanh hơn và tốt hơn delta trong phế quản người nhưng với mức độ nhiễm trùng nhẹ hơn ở phổi. Ngày 15 tháng 12 năm 2021.

20 Viện Quốc gia về Các bệnh Truyền nhiễm. Mạng lưới giám sát gen ở Nam Phi. Cập nhật giám sát bộ gen SARS-CoV -2. Ngày 17 tháng 12 năm 2021.